כפר הנוער ניצנה מהווה בית לאוכלוסייה מגוונת של חניכים ממכינות קדם-צבאיות, מהחברה הבדואית ומקהילות חרדיות ברחבי הארץ. תכנון הקמפוס הובל מתוך תפיסה של השתלבות בנוף המדברי, תוך שימוש באבנים טבעיות והמשכיות לשפה העיצובית המקומית. בתכנון הושם דגש רב על היבטים אקלימיים כגון גובה הבינוי, מיקום הפתחים, כיווני הרוח וזרימת האוויר במבנים.

הפרוגרמה התכנונית נולדה מתוך שיתוף פעולה עם תנועת "השומר החדש" ומענה לצרכים המשתנים של הכפר. הקמפוס כולל מבנה חינוך עם כיתות, מעבדות וחממות מחקר, לצד משרדים, ספרייה ומרכז למידה. בנוסף, נבנתה פנימייה עבור 100 חניכים, ופותח שטח ציבורי רחב הכולל מתקני ספורט, שבילים, פרגולות הצללה ושטחים ירוקים.